經絡是人體氣血運行的通路，內屬於臟腑，外佈於全身，將各部組織、器官聯結成為一個有機的整體。『經』，指經脈，猶如直通的徑路，是經絡系統中的主幹；『絡』，指絡脈，猶如網絡，是經脈的細小分支。經絡，是經脈和絡脈的總稱。經絡系統的內容，包括十二經脈、奇經八脈、十五絡脈、十二經別、十二經筋、十二皮部等。
《靈樞‧海論》說：「夫十二經脈者，內屬於府藏，外絡於支節。」經絡以十二經脈為主，分佈於全身內外，運行氣血，濡養臟腑和皮肉筋骨，使各部功能活動得以正常進行，並保持相對的平衡。《靈樞‧經脈》說：「經脈者，所以能決死生，處百病，調虛實，不可不通。」強調指出研究經絡理論的重要性。
中國之藥物學不但品種之多（本草備要：536種），而且其治療效果也有其獨特一面。中藥的採集、泡制、儲藏、和服法上都有其學問，要發揮中藥的療效在上述各方面都需注意。臨床上在藥物的應用上，要注意「四性」(寒、涼、溫、熱)、「五味」(酸、苦、甘、辛、鹹)、藥物歸經、藥性升降浮沉等之掌握，並注意配伍禁忌。方劑：是藥物治病更進一步的發展，其組織配伍有一定的准則，要掌握「君、臣、佐、使」的用藥規律。古人用藥物調配方劑時，必求於方中有法，法中有方。針對不同病情，在劑型上又有丸、散、膏、丹、湯、酊、洗……等之不同。針對不同病證，在方劑分類上分成補養之劑、理血之劑、除痰之劑、清暑之劑、潤燥之劑……等。
八綱辯證是中醫診斷疾病分類的綱領，其內容包括陰陽、表裏、寒熱、虛實等。其中「陰、陽」是其它證型的總綱，表證、熱證、實證是屬於「陽證」，而裏證、寒證、虛證則屬於「陰證」的範疇。「表裏」的意義在於辨別疾病的部位和深淺，「寒熱」則在辨別疾病的性質，而「虛實」可了解正氣和邪氣的強弱狀態。實際上中醫診治疾病還有其它診斷證型系統。在外感疾病中，主要有針對風寒病邪之《傷寒論》「六經辯證」，針對風熱病邪之葉天士《外感溫熱篇》「衛氣營血辯證」以及吳鞠通《溫病條辨》「三焦辯證」，以對疾病分級、分類和病情預後作了系統性的整理。此外，從中醫基礎理論發展出「臟腑辯證」、「經絡辯證」、「氣血辯證」、「津液辯證」、「六淫辯證」、「七情辯證」、「飲食痰濕辯證」等。
四診：中醫學的診斷方法，主要為望、聞、問、切等四種診察方法，是醫師搜集患者病情資料的方式。重點在於中醫使用四診，必須建立在中醫學傳統的理論基礎上，所搜集到的內容必須是在作中醫學之八綱辯證和其它辯證的證型分析上有用的數據。
陰陽五行學說是中國古代科學上最常應用的方法，這種從內經中所記載的方法論，也被應用於中醫學的理論的應用：在生理上，以陰陽分氣血、臟腑，以五行屬性配合五臟以及人體各器官的歸屬，並以五行相生相克的關系來解釋五臟之間生理上的聯系；在病理上，以陰陽分表裏、虛實、寒熱，以五行歸屬對六淫(外因)、七情(內因)加以分類，並以五行相生相克關系解釋五臟之間的病理聯系；在診斷上，以陰陽、五行的歸類，最為八綱辨證以及各種辨證的分類基礎；在治療藥物的歸類上，以陰陽概念將藥性分為寒、涼、溫、熱等四性，以五行分類將藥物藥性做酸、苦、甘、辛、鹹等五味，以及五髒歸經的分類。
